日時

平成１９年３月２０日９：００　～　２２日１２：３０　
(２泊３日　遠距離から参加の場合は３泊４日)

講師

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　（敬称略）

京都大学　大学院農学研究科　                      西岡　孝明
奈良先端科学技術大学院大学　情報科学研究科　金谷　重彦
慶應義塾大学 先端生命科学研究所　               蓬莱　尚幸
京都大学　バイオインフォマティクスセンター      　服部　正泰
東京大学　大学院新領域創成科学研究科          有田　正規

場所

講義：　さわやか千葉県民プラザ　実習室

宿泊：　さわやか千葉県民プラザ
277-0882 千葉県柏市柏の葉４－３－１
tel. 04-7140-8600
http://www.pref.chiba.jp/clis/index.htm
学生は男女別の相部屋になります。部屋割りは採用後に連絡します。

参加資格

Javaの素養がありケミカルバイオロジーに興味を持つ、新領域または全国の博士課程の学生（意欲のある学部生、修士学生も可)、１５名程度。

演習にはノートPCが必要です。持参が望ましいですが、持たない人にはワークショップ期間内の貸与も可能です。

※新領域COE-RAで、ワークショップ幹事を担当してくれる人を募集中。希望者は下記メールアドレスまで連絡ください。

参加費

旅費はCOEより支給します。食事代は自己負担です。また、新領域の学生に交通費は支給されません。

申し込み方法

　申し込みは締め切りました。

プログラム

20日

• 9:20-10:50 講義 メタボローム、ケミカルバイオロジーという考え方について　(京都大学　西岡先生)
  生化学の基礎（化学結合、酸と塩基、アミノ酸の特徴、不斉、互変異性、芳香環、質量分析の仕組み、精密質量、マススペクトル）
• 11:00-12:30　講義 環構造や化学基など構造情報の基礎 （慶應義塾大学　蓬莱先生）
  化合物構造の情報処理（MOLフォーマット、不斉の表現法、グラフ構造、グラフの探索、InChiコード、SMILESコード）
• 12:30-13:30 昼食
• 13:30-18:00 プログラミング演習 （講師全員）
  課題：ＭＯＬフォーマットを読み込み、グラフ表現するプログラムを作成します 。上級者は環構造の認識や、グラフ半径の計算をおこないます。
• 18:00-19:30 夕食 (さわやか千葉県民プラザ)
• 19:30-21:00 講演、討論会
  午後課題の解説および、不斉炭素の取り扱いについての講義

 

 

21日

• 9:20-10:50 講義　酵素反応と構造変化 (服部先生)
  酵素反応のパターン（酸化還元反応、転移反応、加水分解反応などEC分類の解説。代謝物の構造バリエーション）
• 11:00-12:30　講義　パスウェイからネットワーク（有田）
• 12:30-13:30 昼食
• 13:30-18:00 プログラミング演習 （講師全員）
  MOLビットベクターによる部分構造検出、簡単な部分構造検索プログラムの作成をおこないます。
• 18:00-19:30 夕食 (さわやか千葉県民プラザ)
• 19:30-21:00 講演、討論会
  午後課題の解説と、実際のビットベクター法についての講義

 

22日

• 9:20-10:50 講義 さまざまな二次代謝物の世界 (金谷先生)
  フラボノイド、ジベルリン、抗生物質など、代謝物が持つ構造の特徴。
• 11:00 - 12:30　まとめと修了式
  課題の提出方法、今後の予定などを説明

集合時間

20日朝9:00に、さわやか千葉県民プラザに集合。